More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1985 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  72.78 
 
 		 555 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  76.57 
 
 		 547 aa  845    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  71.43 
 
 		 555 aa  790    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  100 
 
 		 554 aa  1122    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  69.93 
 
 		 552 aa  785    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  52.53 
 
 		 554 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  51.79 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  51.83 
 
 		 545 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  51.21 
 
 		 542 aa  541  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  50.64 
 
 		 547 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  50 
 
 		 547 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  49.26 
 
 		 544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  31.85 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  34.16 
 
 		 624 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  29.96 
 
 		 563 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  30.3 
 
 		 638 aa  223  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.48 
 
 		 584 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  31.83 
 
 		 625 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  31.32 
 
 		 601 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 583 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.14 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.65 
 
 		 575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.47 
 
 		 575 aa  200  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  32.43 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  27.01 
 
 		 597 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 601 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.41 
 
 		 538 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  29.61 
 
 		 604 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.47 
 
 		 539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 587 aa  184  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  30.74 
 
 		 648 aa  181  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  33.62 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  25.68 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  32.19 
 
 		 569 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  32.31 
 
 		 525 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.06 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.87 
 
 		 564 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  28.29 
 
 		 650 aa  167  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.31 
 
 		 539 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.29 
 
 		 548 aa  164  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.23 
 
 		 592 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.4 
 
 		 620 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  32.01 
 
 		 556 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.05 
 
 		 532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  30.13 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.82 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.69 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.43 
 
 		 522 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.93 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.41 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.32 
 
 		 543 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  27.91 
 
 		 583 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  27.91 
 
 		 583 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.01 
 
 		 545 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  29.98 
 
 		 540 aa  149  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.84 
 
 		 541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  29.96 
 
 		 537 aa  147  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 585 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 618 aa  145  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 569 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.08 
 
 		 543 aa  144  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.34 
 
 		 546 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 530 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  28.38 
 
 		 543 aa  143  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.53 
 
 		 564 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.07 
 
 		 556 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 626 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.29 
 
 		 542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.8 
 
 		 556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 606 aa  136  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.36 
 
 		 589 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.58 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.13 
 
 		 527 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.09 
 
 		 574 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.1 
 
 		 562 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  24.42 
 
 		 557 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  27.66 
 
 		 539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.06 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.81 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  26.06 
 
 		 549 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.66 
 
 		 569 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.79 
 
 		 583 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 		 603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  23.95 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.28 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.68 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  27.91 
 
 		 551 aa  126  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  27.96 
 
 		 547 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.43 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.88 
 
 		 543 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>