More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0061 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1755  twin-arginine translocation pathway signal  64.85 
 
 		 332 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0203925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  56.5 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  59.42 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3014  hypothetical protein  57.72 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3733  hypothetical protein  57.72 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  53.21 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0838  hypothetical protein  56.19 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0037307  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  55.99 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  44.75 
 
 		 351 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.72 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.72 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.36 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.39 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.61 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.42 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  40.06 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.13 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.48 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.94 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.33 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.19 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.74 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.39 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.39 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  39.76 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.01 
 
 		 331 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.38 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.27 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.94 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.2 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  39.27 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  39.73 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  37.92 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  40.48 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.28 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.27 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.56 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.73 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.62 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.36 
 
 		 335 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.91 
 
 		 327 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  39.94 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.35 
 
 		 328 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.25 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  37.91 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.94 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.22 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.01 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.59 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  35.93 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.42 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.42 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.54 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.54 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  38.51 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.61 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.21 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.92 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.05 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.31 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  36.54 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.27 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.7 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.07 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.37 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  38.46 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.88 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.8 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.74 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.5 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  36.76 
 
 		 329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  34.48 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.33 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  35.56 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.47 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.39 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  38.38 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.04 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  36.91 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.94 
 
 		 349 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.07 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  39.07 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  33.95 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.88 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.56 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.77 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.41 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.02 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  38.66 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.37 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.11 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>