More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4150 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  100 
 
 		 373 aa  775    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  45.86 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  45.43 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  45.43 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  45.43 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  45.43 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  45.43 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  45.43 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  45.43 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  43.5 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  42.5 
 
 		 395 aa  272  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  42.03 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  42.03 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  41.32 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  42.22 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  43.61 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  44.15 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  36.94 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  37.09 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  34.67 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  37.09 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  37.09 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  41.3 
 
 		 519 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  28.54 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  28.54 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  28.54 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  27.44 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  29.16 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  29.16 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  29.16 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  29.16 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  27.85 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  27.85 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  27.85 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  27.85 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  27.85 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  27.85 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  27.85 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  26.69 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  26.69 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  26.69 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  24.93 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  24.93 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  24.93 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  43.85 
 
 		 141 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  27.84 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  27.84 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4792  phage integrase family protein  24.28 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2265  phage integrase family protein  24.28 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2972  phage integrase family protein  24.28 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  26.4 
 
 		 291 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  27.01 
 
 		 292 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 		 295 aa  89.7  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 286 aa  87  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  23.35 
 
 		 310 aa  86.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.17 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.49 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24.55 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  25.31 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.56 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  24 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.65 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  23.29 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.4 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  24.85 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  28.78 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  27.38 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  25.89 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.6 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  23.96 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  29.8 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.84 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.4 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  22.81 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.67 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  25.08 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.67 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.92 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  26.52 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.82 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  23.31 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>