More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5557 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.15 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  65.87 
 
 		 228 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.88 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 228 aa  245  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  64.32 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.75 
 
 		 217 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  64.9 
 
 		 212 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  62.32 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.68 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.63 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.705317  normal  0.304873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.55 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.48 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  61.09 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.27 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.19 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.11 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.14 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.66 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  59.91 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.19 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.52 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  57.4 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  60.19 
 
 		 220 aa  205  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  53.85 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  49.78 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  41.23 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  39.44 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  40.85 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 223 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  38.76 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  38.28 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.79 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 1648 aa  131  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  38.07 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.2 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.2 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  40.31 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  40.31 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  42.18 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  40.31 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  40.31 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  40.31 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  41.33 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  41.33 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  41.33 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  41.33 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  41.33 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  41.33 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  41.33 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  41.33 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  42.25 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  36.32 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>