More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2006 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
594 aa  652    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  65.99 
 
 
645 aa  831    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  64.23 
 
 
642 aa  807    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
614 aa  649    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  66.72 
 
 
629 aa  853    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  54.11 
 
 
610 aa  671    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 
606 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
614 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  51.81 
 
 
614 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  51.81 
 
 
614 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  72.45 
 
 
613 aa  911    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  71.1 
 
 
622 aa  898    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  64.25 
 
 
636 aa  815    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 
608 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  72.45 
 
 
650 aa  904    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0578  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 
609 aa  639    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0310674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 
614 aa  635    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  70.62 
 
 
620 aa  900    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
614 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
614 aa  649    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  51.62 
 
 
614 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2163  GTP-binding protein TypA  62.44 
 
 
642 aa  742    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  51.64 
 
 
614 aa  648    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.8 
 
 
602 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  61.38 
 
 
640 aa  780    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1144  GTP-binding protein TypA  59.62 
 
 
635 aa  716    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  66.03 
 
 
640 aa  815    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
614 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  66.4 
 
 
630 aa  836    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  71.64 
 
 
617 aa  907    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
614 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  55.23 
 
 
615 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  72.29 
 
 
620 aa  921    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  58.74 
 
 
608 aa  729    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  57.21 
 
 
643 aa  722    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.74 
 
 
614 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  67.3 
 
 
633 aa  833    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  71.64 
 
 
617 aa  913    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  52.47 
 
 
608 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
620 aa  1247    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  64.72 
 
 
629 aa  833    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  62.36 
 
 
633 aa  745    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  58.76 
 
 
605 aa  735    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 
616 aa  654    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  54.9 
 
 
615 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4040  GTP-binding protein TypA  62.36 
 
 
633 aa  745    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  64.57 
 
 
633 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  54.9 
 
 
615 aa  653    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  50.99 
 
 
614 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 
610 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  52.57 
 
 
610 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  65.76 
 
 
645 aa  824    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  73.91 
 
 
617 aa  911    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  71.41 
 
 
630 aa  904    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  70.02 
 
 
630 aa  868    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  65.03 
 
 
636 aa  820    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  61.97 
 
 
628 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 
605 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  58.21 
 
 
608 aa  738    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  62.92 
 
 
642 aa  815    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.37 
 
 
616 aa  663    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  57.55 
 
 
594 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  70.81 
 
 
641 aa  903    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  57.68 
 
 
641 aa  729    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  67.47 
 
 
635 aa  842    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 
608 aa  660    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  67.78 
 
 
631 aa  848    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  66.5 
 
 
624 aa  848    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  62.36 
 
 
633 aa  745    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  60.22 
 
 
636 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4540  GTP-binding protein TypA  61.08 
 
 
634 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  51.47 
 
 
612 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  50.74 
 
 
613 aa  628  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 
614 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  51.47 
 
 
615 aa  630  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  52.89 
 
 
613 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  53.38 
 
 
592 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  52.7 
 
 
613 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 
627 aa  623  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 
601 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  49.34 
 
 
603 aa  622  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 
598 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  50.99 
 
 
601 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 
598 aa  621  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 
613 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 
593 aa  620  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  51.48 
 
 
613 aa  619  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  49.09 
 
 
615 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 
611 aa  613  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  49.01 
 
 
608 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
615 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
615 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
600 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
619 aa  611  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  51.07 
 
 
608 aa  608  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  48.19 
 
 
612 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 
608 aa  611  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 
599 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 
613 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  50.08 
 
 
603 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>