More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0345 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  39.27 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 255 aa  101  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  39 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  35.05 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 252 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 262 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 265 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  37.99 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 262 aa  91.7  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 256 aa  88.6  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  39.23 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>