More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6691 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  77.71 
 
 
178 aa  294  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  46.37 
 
 
180 aa  163  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  44.13 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  38.73 
 
 
194 aa  130  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  38.42 
 
 
172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.21 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.15 
 
 
199 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  39.11 
 
 
178 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.23 
 
 
178 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  33.9 
 
 
174 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 
173 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  33.9 
 
 
173 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.33 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  32.77 
 
 
173 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  37.08 
 
 
175 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.69 
 
 
183 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  35.36 
 
 
183 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  34.86 
 
 
181 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 
173 aa  104  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
181 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
192 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
182 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  33.5 
 
 
191 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.67 
 
 
182 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.89 
 
 
192 aa  101  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  32.39 
 
 
173 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.51 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
194 aa  99  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.69 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  29.31 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  33.15 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.05 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  34.3 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.4 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  32.07 
 
 
189 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  29.74 
 
 
195 aa  90.9  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.9 
 
 
174 aa  90.9  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  30.94 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  28.04 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
187 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.86 
 
 
188 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 
175 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.81 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
190 aa  87.4  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  29.51 
 
 
185 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
178 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.25 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.68 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.39 
 
 
197 aa  84.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 
177 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  32.37 
 
 
198 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.78 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.27 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  28.93 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.07 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  29.38 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  32.46 
 
 
199 aa  82  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  28.93 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.96 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.96 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  28.87 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  29.26 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.74 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  30.3 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  33.91 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  30.11 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.69 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.14 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  29.41 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  29.26 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.73 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  28.99 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>