More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3115 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  100 
 
 		 606 aa  1233    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  37.34 
 
 		 624 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  34.04 
 
 		 626 aa  339  8e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 		 625 aa  329  8e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 596 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  35.8 
 
 		 593 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  35.3 
 
 		 603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  32.76 
 
 		 618 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  33.69 
 
 		 594 aa  268  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  34.78 
 
 		 594 aa  257  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  33.11 
 
 		 614 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  39.72 
 
 		 616 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  37.38 
 
 		 610 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  29.79 
 
 		 616 aa  250  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.71 
 
 		 600 aa  246  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 609 aa  246  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  28.69 
 
 		 604 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 		 592 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  30.84 
 
 		 619 aa  243  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  30.94 
 
 		 588 aa  243  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  36.57 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  27.96 
 
 		 618 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  27.96 
 
 		 618 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  34.46 
 
 		 622 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  34.96 
 
 		 611 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  32.29 
 
 		 603 aa  234  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  32.13 
 
 		 611 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  39.24 
 
 		 625 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  29.74 
 
 		 615 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  33.82 
 
 		 613 aa  231  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  27.07 
 
 		 618 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  28.87 
 
 		 623 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 		 608 aa  229  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  32.57 
 
 		 592 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  37.34 
 
 		 625 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.84 
 
 		 603 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  28.46 
 
 		 621 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  29.57 
 
 		 615 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  28.28 
 
 		 621 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  29.44 
 
 		 611 aa  220  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  28.09 
 
 		 621 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  27.75 
 
 		 623 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  45.53 
 
 		 604 aa  213  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  37.76 
 
 		 613 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  31.2 
 
 		 597 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.57 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.49 
 
 		 633 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  26.92 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  31.22 
 
 		 627 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  34.82 
 
 		 599 aa  203  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.29 
 
 		 606 aa  203  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 608 aa  203  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  29.33 
 
 		 625 aa  203  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  34.04 
 
 		 605 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  37.59 
 
 		 623 aa  200  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.73 
 
 		 621 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  33.6 
 
 		 566 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 596 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  28.7 
 
 		 626 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.67 
 
 		 582 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.14 
 
 		 605 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  28.44 
 
 		 582 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3684  ABC transporter related  38.72 
 
 		 714 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.56 
 
 		 582 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  30.6 
 
 		 637 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.26 
 
 		 597 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  38.52 
 
 		 598 aa  193  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.87 
 
 		 608 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  30.48 
 
 		 637 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  36.36 
 
 		 621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.81 
 
 		 582 aa  191  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.81 
 
 		 582 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.63 
 
 		 597 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.81 
 
 		 582 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.9 
 
 		 597 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  35.13 
 
 		 606 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.41 
 
 		 594 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.39 
 
 		 589 aa  190  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.16 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  32.88 
 
 		 621 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.3 
 
 		 583 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  28.21 
 
 		 631 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  34.93 
 
 		 579 aa  187  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.25 
 
 		 625 aa  187  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  29 
 
 		 619 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.07 
 
 		 596 aa  187  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.3 
 
 		 583 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  30.49 
 
 		 611 aa  187  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.3 
 
 		 593 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.3 
 
 		 623 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.8 
 
 		 590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.81 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.02 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.34 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.82 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  37.16 
 
 		 701 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>