More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0539 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  100 
 
 		 308 aa  633    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  53.81 
 
 		 223 aa  229  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  46.12 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  50 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.76 
 
 		 248 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  44.97 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  37.54 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  33.33 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.32 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  34.51 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.92 
 
 		 286 aa  160  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.93 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  32.81 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  34.07 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  33.46 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  34.07 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  31.45 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.33 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  34.45 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  31.13 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  32.01 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  44.17 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  32.64 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.94 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  45.12 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  31.88 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  50.41 
 
 		 524 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  44.51 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  42.86 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  33.48 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  51.22 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  36.82 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  33.47 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  33.46 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.36 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  52.07 
 
 		 411 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  52.07 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.84 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  53.54 
 
 		 438 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  39.24 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  40.48 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  46.28 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  52.59 
 
 		 431 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  52.59 
 
 		 431 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  43.66 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  56.52 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  56.52 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  45.53 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  49.18 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  56.52 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  56.52 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  35.27 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  52.59 
 
 		 431 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  48.46 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  51.85 
 
 		 431 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  55.65 
 
 		 424 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  49.59 
 
 		 373 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.09 
 
 		 442 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  40.11 
 
 		 400 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  51.97 
 
 		 434 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  50.82 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.74 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  49.59 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  48.72 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  29.89 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  43.75 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.32 
 
 		 445 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  41.18 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  52.07 
 
 		 582 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  51.18 
 
 		 418 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  29.82 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  49.59 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  51.97 
 
 		 419 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  35.12 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.09 
 
 		 430 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  42.58 
 
 		 404 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  50.39 
 
 		 458 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  39.22 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  48.51 
 
 		 443 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  34.85 
 
 		 379 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  46.36 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  47.97 
 
 		 468 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  48.78 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  48.95 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  42.11 
 
 		 443 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  43.07 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  34.6 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.09 
 
 		 527 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  35.6 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  30.34 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  38.89 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  49.57 
 
 		 513 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  41.21 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  44.74 
 
 		 490 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  50.86 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  41.84 
 
 		 333 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  48.72 
 
 		 446 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  45.97 
 
 		 372 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  48.21 
 
 		 429 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>