More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1818 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  78.38 
 
 		 223 aa  364  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  74.32 
 
 		 223 aa  357  9e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  74.32 
 
 		 222 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  73.87 
 
 		 223 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  70.27 
 
 		 223 aa  341  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  67.57 
 
 		 222 aa  332  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  49.78 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  43.05 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  49.1 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  41.47 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  45.37 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  44.91 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  44.95 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  42.34 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  44.89 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  43.56 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  45.74 
 
 		 231 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  45.74 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  43.24 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  41.96 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  41.44 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  45.62 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  41.89 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  43.18 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  47.06 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  40.35 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1752  DNA repair protein RadC  47.78 
 
 		 184 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.351254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1718  DNA repair protein RadC  47.78 
 
 		 184 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  42.18 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  40.28 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  41.01 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  41.31 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  42.08 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1225  truncated DNA repair protein RadC  47.78 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.247593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  38.79 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  40.85 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  46.89 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  39.71 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  37.27 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  38.76 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  37.27 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  40.47 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  37.27 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  36.44 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  39.62 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4561  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000169917  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  35.89 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  40.45 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  35.89 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  35.89 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  35.89 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>