More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02180 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  100 
 
 
759 aa  1558    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.85 
 
 
653 aa  642    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  65.82 
 
 
682 aa  653    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.25 
 
 
615 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.58 
 
 
750 aa  1010    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  66.1 
 
 
753 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  71.21 
 
 
783 aa  950    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.55 
 
 
672 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  66.38 
 
 
654 aa  661    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.6 
 
 
753 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.85 
 
 
679 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.98 
 
 
672 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  60.52 
 
 
656 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.23 
 
 
685 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.03 
 
 
651 aa  626  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  61.41 
 
 
627 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.18 
 
 
639 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.74 
 
 
684 aa  624  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.9 
 
 
682 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.21 
 
 
671 aa  618  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.79 
 
 
630 aa  618  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.64 
 
 
620 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.4 
 
 
662 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.92 
 
 
657 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.5 
 
 
669 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.25 
 
 
611 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.5 
 
 
671 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.19 
 
 
687 aa  611  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.67 
 
 
684 aa  611  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.73 
 
 
640 aa  611  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.44 
 
 
607 aa  611  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.41 
 
 
651 aa  609  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  60.49 
 
 
689 aa  611  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  57.14 
 
 
681 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.48 
 
 
669 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.17 
 
 
632 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  58.22 
 
 
616 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  59.08 
 
 
645 aa  605  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.51 
 
 
743 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.94 
 
 
640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.01 
 
 
608 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.96 
 
 
599 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  54.41 
 
 
641 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.97 
 
 
642 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 
608 aa  600  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.06 
 
 
659 aa  602  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 
604 aa  601  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.23 
 
 
760 aa  601  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.65 
 
 
639 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.96 
 
 
635 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  58.28 
 
 
637 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
634 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  51.65 
 
 
639 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  57.79 
 
 
499 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.08 
 
 
643 aa  598  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 
602 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.72 
 
 
638 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.05 
 
 
640 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.3 
 
 
656 aa  598  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.39 
 
 
676 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.68 
 
 
798 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.13 
 
 
793 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.51 
 
 
610 aa  595  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.45 
 
 
671 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.36 
 
 
612 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.51 
 
 
610 aa  595  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  59.15 
 
 
665 aa  595  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.6 
 
 
639 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.24 
 
 
617 aa  592  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.82 
 
 
601 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.48 
 
 
643 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 
638 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  60.26 
 
 
760 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.01 
 
 
612 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.02 
 
 
645 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.99 
 
 
616 aa  591  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.78 
 
 
630 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  55.85 
 
 
626 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.93 
 
 
630 aa  591  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.91 
 
 
637 aa  592  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  58.42 
 
 
613 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.29 
 
 
645 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.82 
 
 
601 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  62.37 
 
 
613 aa  589  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.61 
 
 
696 aa  590  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.17 
 
 
642 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.17 
 
 
614 aa  591  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.98 
 
 
640 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.21 
 
 
612 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.95 
 
 
640 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.94 
 
 
640 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  58.03 
 
 
644 aa  588  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 
631 aa  588  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  54.71 
 
 
641 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.19 
 
 
631 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.71 
 
 
641 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
655 aa  588  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 
652 aa  585  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 
781 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.97 
 
 
616 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>