More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2201 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  837    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  50.12 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  46 
 
 		 402 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  40.45 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  45.79 
 
 		 402 aa  290  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  39.7 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  47.61 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  40.31 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  35.81 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  35.81 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  31.99 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  32.13 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  30.45 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  33.85 
 
 		 378 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.82 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  30 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.82 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  30.45 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  33.54 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  34.92 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  35.29 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  34.19 
 
 		 383 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  31.05 
 
 		 376 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.23 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  35.18 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  35.9 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.45 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  30.5 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  28.34 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.13 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  27.82 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  31.27 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  30.39 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  28.34 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  30.73 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  27.2 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  26.88 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  30.23 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  32.09 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  30.51 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  32.07 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  33.89 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.64 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  31.13 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  32.93 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  30.72 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  32.66 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  27.72 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  30.72 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  31.49 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  27.78 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  31.48 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  30.62 
 
 		 376 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  33.23 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  29.35 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30.1 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  29.85 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  31.79 
 
 		 385 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  34.06 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  33.33 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  31.1 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  28.2 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  26.9 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  31.19 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  30.24 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  29.84 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  26.25 
 
 		 436 aa  87  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  28.62 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  27.1 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  26.32 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  25.15 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  32.52 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  26.64 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  30.49 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  24.31 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  25.26 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.99 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0277  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.35 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  24.23 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.21 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.16 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  27.45 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  22.11 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.46 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.33 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.65 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.1 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.11 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.84 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  31.8 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  24.13 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.95 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.65 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>