More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0243 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
352 aa  718    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  62.29 
 
 
378 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  51.68 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 
354 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  32.01 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  30.51 
 
 
333 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
360 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  31.12 
 
 
345 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  30.27 
 
 
357 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
375 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
396 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  29.82 
 
 
386 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  28.78 
 
 
363 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
367 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
376 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
382 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  37.25 
 
 
501 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.96 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  35.64 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.4 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.44 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.44 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.77 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  35.97 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  35.97 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  44.33 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  44.33 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.32 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  32.43 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.64 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  32.43 
 
 
256 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  36.05 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  41.3 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  32.43 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  32.81 
 
 
714 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  33.07 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.5 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  37.5 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.5 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  40.96 
 
 
283 aa  67  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  42.68 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  35 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0734  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.92 
 
 
487 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321849  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  33.04 
 
 
247 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0714  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  34.88 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1189  extracellular solute-binding protein family 3  37.04 
 
 
252 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  31.19 
 
 
257 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
285 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  33.06 
 
 
270 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
266 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  30.28 
 
 
257 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
247 aa  63.5  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  32.28 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
492 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  30.89 
 
 
270 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  33.73 
 
 
736 aa  63.2  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  32.97 
 
 
727 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1594  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 
233 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1524  putative periplasmic binding protein  34.57 
 
 
253 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.240287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1812  hypothetical protein  34.57 
 
 
253 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  38.55 
 
 
286 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 
281 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1749  putative periplasmic binding protein  34.57 
 
 
253 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.256015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1752  putative periplasmic binding protein  34.57 
 
 
253 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  36.05 
 
 
272 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 
260 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  36.45 
 
 
281 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.18 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.87 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.51 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  26.89 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.64 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>