More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2399 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  99.04 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  64.59 
 
 		 210 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  63.64 
 
 		 211 aa  279  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  61.72 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  62.68 
 
 		 209 aa  268  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 		 211 aa  267  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  60.29 
 
 		 209 aa  265  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  60.48 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  59.42 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  60.1 
 
 		 209 aa  257  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  58.85 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  56.94 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 210 aa  250  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  58.85 
 
 		 208 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  58.8 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 210 aa  247  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  56.94 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  59.13 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  57.87 
 
 		 220 aa  244  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  56.44 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 211 aa  240  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  54.23 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  53.14 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 207 aa  228  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 213 aa  228  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 213 aa  228  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  227  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  56.02 
 
 		 217 aa  224  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 218 aa  224  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 228 aa  220  9e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  50.49 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  52.02 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 221 aa  218  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 207 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 207 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  52.82 
 
 		 211 aa  216  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  50.77 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  51.28 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04521  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 207 aa  215  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000554969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  52.43 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  53.57 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 209 aa  214  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  51.79 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 218 aa  211  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  210  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  51.79 
 
 		 211 aa  210  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  50.72 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  53.57 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>