151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1855 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
423 aa  849    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  98.82 
 
 
423 aa  842    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  98.82 
 
 
423 aa  839    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
381 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
388 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  29.47 
 
 
397 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  26.36 
 
 
396 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  27.95 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  28.03 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  24.58 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  25.12 
 
 
403 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  29.56 
 
 
402 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  27.61 
 
 
357 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  27.2 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  23.21 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  26.89 
 
 
409 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
414 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
414 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  26.37 
 
 
409 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  25.42 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.38 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  27.22 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  27.22 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  27.22 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
394 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  24.32 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  24.85 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.48 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  20.69 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  26.74 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  22.19 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  25.6 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  21.28 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  25.58 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.12 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.12 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  21.14 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  21.73 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  23.67 
 
 
388 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  25.7 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  22.26 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  24.84 
 
 
394 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
850 aa  57  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  22.19 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
410 aa  56.6  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  21.53 
 
 
405 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.95 
 
 
387 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  24.2 
 
 
387 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  23.89 
 
 
392 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  24.49 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  24.49 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  24.49 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  24.49 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  24.49 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  24.52 
 
 
393 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  28.74 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  24.78 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  23.71 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  22.29 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  21 
 
 
415 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.75 
 
 
387 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  25.55 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  21.82 
 
 
403 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  23.89 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  25.75 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.04 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  24.68 
 
 
393 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
390 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  24.27 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  23.93 
 
 
393 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.93 
 
 
393 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  24.27 
 
 
387 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  19.93 
 
 
416 aa  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  22.78 
 
 
399 aa  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  26.22 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  26.24 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  26.25 
 
 
358 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.84 
 
 
545 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  29.07 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  22.54 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>