57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11371 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_11371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  100 
 
 
408 aa  793    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1057  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter-like  74.26 
 
 
409 aa  584  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.464122  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11511  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  73.33 
 
 
409 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11521  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  72.84 
 
 
409 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11461  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  41.69 
 
 
416 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0988673  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0699  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  35.75 
 
 
432 aa  249  8e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0364966  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0707  major facilitator superfamily permease  34.42 
 
 
412 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15411  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.34 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  0.866892 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1962  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.29 
 
 
400 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.593105  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.47 
 
 
419 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 
478 aa  57  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.9 
 
 
493 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  32.04 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  32.04 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  32.04 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  21.28 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.09 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 
517 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  19.89 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  19.61 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  19.89 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  19.89 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  19.89 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  19.89 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  22.07 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  19.61 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  19.61 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  19.15 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  20.14 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  28.16 
 
 
565 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.85 
 
 
534 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  19.61 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  27.71 
 
 
566 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  31.25 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 
516 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  25.26 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  20.73 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  31.75 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.3 
 
 
514 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  29.05 
 
 
422 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  22.34 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  37.04 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  25.71 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 
523 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  24.06 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01157  multidrug resistance membrane translocase  27.36 
 
 
501 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.59 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.7 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.59 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  25.23 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 
397 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 
510 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  24.06 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>