54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_11521 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_11511  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  97.56 
 
 
409 aa  726    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11521  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  100 
 
 
409 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1057  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter-like  89.73 
 
 
409 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.464122  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  72.84 
 
 
408 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11461  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  39.95 
 
 
416 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0988673  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0699  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.2 
 
 
432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0364966  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15411  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  36.48 
 
 
412 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  0.866892 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1962  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.39 
 
 
400 aa  223  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.593105  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0707  major facilitator superfamily permease  35.35 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.94 
 
 
419 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 
493 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  21.87 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  21.53 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  20.96 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  21.25 
 
 
397 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  20.96 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  21.25 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  21.25 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  21.25 
 
 
397 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  21.25 
 
 
397 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  20.96 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  20.96 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  22.22 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.95 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  20.72 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  36.49 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  21.51 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  19.95 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  30.23 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
419 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  20.4 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  27.69 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  28.47 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  29.46 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.98 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  22.14 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  21.11 
 
 
510 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 
475 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  23.4 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  19.1 
 
 
517 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.82 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.88 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 
520 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  27.47 
 
 
403 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 
520 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 
520 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  28.87 
 
 
467 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.69 
 
 
514 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.69 
 
 
516 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.01 
 
 
423 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  33.82 
 
 
683 aa  42.7  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>