43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1057 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1057  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter-like  100 
 
 		 409 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.464122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11521  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  89.73 
 
 		 409 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11511  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  90.71 
 
 		 409 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  74.26 
 
 		 408 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11461  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  40.15 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0988673  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0699  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  36.1 
 
 		 432 aa  239  9e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0364966  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15411  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  35.56 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  0.866892 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0707  major facilitator superfamily permease  34.75 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1962  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.1 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.593105  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  20.45 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  22.47 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  20.4 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.41 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  20.4 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  22.38 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  19.83 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  18.51 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  19.55 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  19.83 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  19.83 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  20.11 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  20.64 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  19.83 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  19.83 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  20.4 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 565 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2800  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0579957  hitchhiker  0.00000851422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 566 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 529 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 529 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  19.87 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>