23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11461 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_11461  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  100 
 
 		 416 aa  815    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0988673  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0699  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  44.5 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0364966  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1962  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  44.53 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.593105  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0707  major facilitator superfamily permease  42.13 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15411  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  42.62 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  0.866892 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  41.69 
 
 		 408 aa  302  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11511  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  41.44 
 
 		 409 aa  272  9e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1057  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter-like  40.15 
 
 		 409 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.464122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11521  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  39.95 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1932  amino acid/peptide transporter  25.13 
 
 		 536 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000463259  hitchhiker  0.00239553 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  31.73 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>