45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0699 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0699  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  100 
 
 		 432 aa  845    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0364966  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1962  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  74.23 
 
 		 400 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.593105  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11461  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  44.5 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0988673  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15411  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  36.79 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  0.866892 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0707  major facilitator superfamily permease  36.63 
 
 		 412 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.44 
 
 		 408 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1057  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter-like  35.01 
 
 		 409 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.464122  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11511  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  36.2 
 
 		 409 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11521  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  35.95 
 
 		 409 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.11 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 		 526 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3895  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 		 528 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  21.36 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 524 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.69 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 424 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.12 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.33 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  21.69 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  21.69 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 537 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  21.69 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  21.69 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.89 
 
 		 537 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.68 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 		 558 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 		 539 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.89 
 
 		 523 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2918  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0891  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 510 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>