More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0088 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  52.55 
 
 
273 aa  296  3e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1451  thiamine monophosphate kinase  52.92 
 
 
273 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  51.8 
 
 
277 aa  269  5e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1632  thiamine monophosphate kinase  51.82 
 
 
273 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1793  thiamine monophosphate kinase  51.82 
 
 
273 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0405  thiamine monophosphate kinase  51.09 
 
 
273 aa  263  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.88166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  51.82 
 
 
273 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1182  Thiamine-phosphate kinase  44.36 
 
 
274 aa  236  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  41.97 
 
 
275 aa  210  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 
355 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.84 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  29.33 
 
 
318 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  29.46 
 
 
315 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  33.7 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 
317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  28.76 
 
 
330 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  31.1 
 
 
328 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  27.05 
 
 
305 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 
314 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 
327 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  29.29 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  31.41 
 
 
336 aa  125  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 
339 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  29.37 
 
 
325 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  28.28 
 
 
358 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 
354 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 
323 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  32.7 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  26.35 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  32.14 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  29.72 
 
 
341 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  29.96 
 
 
336 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  30.49 
 
 
344 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  25.94 
 
 
333 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 
355 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  30.07 
 
 
334 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  28.67 
 
 
337 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 
363 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.18 
 
 
344 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  28.88 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  28.63 
 
 
344 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  28.28 
 
 
329 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  31.02 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  30.66 
 
 
339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  29.41 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  30.27 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  28.43 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  28.68 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  29.81 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  30.54 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  30.37 
 
 
329 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  29.77 
 
 
318 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  29.49 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  28.05 
 
 
337 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  28.96 
 
 
318 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  27.84 
 
 
332 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  29.53 
 
 
355 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  31.87 
 
 
306 aa  112  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 
322 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  29.05 
 
 
324 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  29.87 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  30.26 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  32.09 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  26.82 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  30.14 
 
 
375 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29 
 
 
350 aa  109  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
331 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 
354 aa  108  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  28.81 
 
 
314 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  25.62 
 
 
330 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  29.8 
 
 
319 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  27.64 
 
 
323 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  34.9 
 
 
370 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  28.16 
 
 
323 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 
321 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  26.91 
 
 
323 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 
319 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0573  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
318 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.929555  normal  0.0493584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  28.47 
 
 
319 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  28.83 
 
 
319 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  26.42 
 
 
318 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 
320 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  28.1 
 
 
323 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  29.09 
 
 
315 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  26.78 
 
 
294 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  27.74 
 
 
323 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  27.74 
 
 
323 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  29.17 
 
 
329 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  27.74 
 
 
323 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  29.56 
 
 
318 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  27.53 
 
 
341 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  27.94 
 
 
325 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29.53 
 
 
352 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  30.66 
 
 
318 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>