More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0397 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 336 aa  689    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  88.69 
 
 		 336 aa  611  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  86.9 
 
 		 336 aa  607  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  37.94 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  39.02 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.79 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  39.4 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  37.28 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.1 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.52 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.55 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.92 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.28 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.56 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.86 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  33.05 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  36.03 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.73 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  33.82 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  34.07 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.59 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  36.66 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  36.21 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  38.64 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  38.73 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  34.76 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  36.19 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  36.39 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  37.81 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  36.19 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  34.71 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.87 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.48 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  36.19 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  38.41 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  35.2 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  36.51 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  36.31 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.66 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  35.26 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  36.22 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.46 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.46 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.39 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.46 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  35.48 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.57 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  36.42 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  34.27 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  37.38 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.94 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  37.65 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  37.65 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  36.22 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  36.89 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  34.66 
 
 		 346 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  36.89 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  34.97 
 
 		 369 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  37.35 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.78 
 
 		 325 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.78 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.78 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.78 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.78 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.78 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.78 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  35.78 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  36.48 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  35.78 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  35.06 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  33.63 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  37.26 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  36.33 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  37.58 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  33.43 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.98 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.98 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  35.44 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  33.44 
 
 		 317 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.71 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  35.39 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  35.19 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  35.8 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  34.97 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  34.41 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  35.01 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  31.09 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  34.35 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.36 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  34.72 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  35.31 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  34.45 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>