More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0358 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 355 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  68.08 
 
 		 354 aa  497  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  63.17 
 
 		 355 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  60.34 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  57.91 
 
 		 363 aa  450  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  59.21 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  53.04 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  44.76 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  42.61 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  43.96 
 
 		 340 aa  265  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  43.25 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  42.4 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  40.43 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  41.46 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  41.1 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  39.82 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  42.5 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  41.12 
 
 		 339 aa  232  9e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.43 
 
 		 334 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 		 337 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  34.75 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.73 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  33.61 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.41 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.21 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  39.4 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.88 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.61 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  36.16 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  35.46 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.98 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 332 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  36.31 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.53 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  32.88 
 
 		 346 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  30.2 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.66 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  34.56 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  35.2 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.48 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  33.9 
 
 		 326 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  34.29 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.46 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  34.17 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  33.85 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  30.34 
 
 		 344 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.24 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.24 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.24 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  36.33 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  34.64 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  31.62 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  32.41 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  30.73 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3453  thiamine-phosphate kinase  31.11 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  31.09 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  32.28 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  32.86 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  34.27 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  31.5 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  32.66 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.12 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.12 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.12 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  36.6 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.78 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  32.86 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  32.86 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  34.08 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  32.86 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  32.86 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  32.86 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  32.86 
 
 		 325 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  32.86 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  31.83 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  32.86 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  32.86 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.8 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  32.14 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  31.61 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  31.32 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  31.03 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>