More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0163 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 338 aa  678    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  42.09 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  42.12 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  41.62 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  42.69 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  41.95 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  39.7 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 325 aa  228  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  41.34 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  41.34 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  38.68 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  40.3 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  39.63 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  38.79 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  38.79 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  38.17 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  39.82 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  39.82 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  39.51 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  38.18 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  41.27 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  39.33 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  38.97 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  39.33 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  39.02 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  39.02 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  39.09 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  39.51 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  42.73 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  40.73 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  38.48 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  39.09 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  39.09 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  38.18 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  40.84 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  38.86 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  39.58 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  40.36 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  39.82 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  37.88 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  40.72 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  41.62 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  38.48 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  39.16 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  35.6 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  41.99 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  39.51 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  34.97 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  43.54 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  41.16 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  39.4 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  35.99 
 
 		 339 aa  210  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 		 334 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  39.82 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  38.3 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  41.03 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  38.07 
 
 		 319 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  38.19 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  39.94 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  39.58 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  40.06 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  41.78 
 
 		 343 aa  202  9e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  38.55 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  38.39 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  38.39 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  40.42 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  40.54 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  37.69 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  39.04 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3453  thiamine-phosphate kinase  36.21 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  44.24 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  40.79 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  35.65 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  42.09 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  38.74 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  38.74 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  42.81 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>