More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2057 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 358 aa  724    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  46.4 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  45.89 
 
 		 355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  44.76 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  44.51 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  44.35 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  43.93 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  44.17 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  44.07 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  43.52 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  42.77 
 
 		 350 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  42.69 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  42.98 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  43.91 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  42.98 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  40.24 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  41.52 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  38.37 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  39.42 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  43.05 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  39.24 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  36.02 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.28 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  35.65 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.66 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  37.79 
 
 		 329 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.96 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  36.05 
 
 		 331 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.34 
 
 		 328 aa  179  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  33.05 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  37.76 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  36.54 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  34.38 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.78 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  32.19 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  36.63 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 		 336 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  37.54 
 
 		 329 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 		 338 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.66 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  35.69 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  35.2 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.81 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  31.82 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  34.19 
 
 		 346 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  36.66 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  35.69 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  32.67 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.73 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.8 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  30.5 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  33.33 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  32.74 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  35.33 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  38.39 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  33.24 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.24 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 		 329 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  32.06 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.75 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  31.88 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  31.56 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  32.08 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.92 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  34.67 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  33.91 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  33.91 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  34.11 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  34.11 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.91 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.91 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  34.11 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  34.11 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  34.11 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  34.11 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  36.39 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  35.96 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  32.84 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  36.99 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  34.5 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  36.28 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  35.17 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  35.01 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  32.38 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  31.18 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>