More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1928 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
354 aa  719    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  66.38 
 
 
355 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  63.84 
 
 
355 aa  475  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  62.61 
 
 
363 aa  477  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  60.34 
 
 
355 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  59.88 
 
 
369 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  58.64 
 
 
354 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  44.07 
 
 
358 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  43.71 
 
 
346 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  45.35 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  43.6 
 
 
340 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  44.62 
 
 
346 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  43.47 
 
 
339 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  41.52 
 
 
348 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  40.48 
 
 
352 aa  252  9.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  41.8 
 
 
344 aa  249  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  41.33 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  39.77 
 
 
334 aa  222  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  38.84 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  39.2 
 
 
334 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  39.6 
 
 
329 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  43.62 
 
 
328 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  38.7 
 
 
323 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.7 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.77 
 
 
327 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.38 
 
 
337 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.11 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  36.83 
 
 
339 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 
331 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 
333 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
318 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.96 
 
 
340 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.43 
 
 
323 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  34.97 
 
 
306 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  36.93 
 
 
329 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.44 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  32.19 
 
 
329 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.11 
 
 
318 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  34.27 
 
 
336 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.04 
 
 
333 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  33.15 
 
 
336 aa  156  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  33.13 
 
 
319 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  36.42 
 
 
323 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.92 
 
 
323 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  34.29 
 
 
323 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  32.02 
 
 
344 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  36.72 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.74 
 
 
344 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  36.72 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  34.29 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  33.61 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  34.88 
 
 
315 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.97 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  31.07 
 
 
332 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 
346 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  35.28 
 
 
318 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.67 
 
 
318 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  34.56 
 
 
326 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.29 
 
 
326 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.67 
 
 
318 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.67 
 
 
318 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  34.08 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  34.58 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.38 
 
 
329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  37.2 
 
 
329 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  34.38 
 
 
329 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  30.09 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  32.82 
 
 
313 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  33.14 
 
 
321 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.44 
 
 
319 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  34.29 
 
 
322 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  29.56 
 
 
332 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.09 
 
 
329 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  31.91 
 
 
324 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  33.62 
 
 
324 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.52 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  34.55 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  35.43 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  31.92 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  30.79 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  34.45 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.74 
 
 
319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.89 
 
 
320 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  31.25 
 
 
341 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  32.29 
 
 
323 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  32.19 
 
 
317 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 
321 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  34.43 
 
 
316 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  31.2 
 
 
330 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  32.56 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  33.54 
 
 
344 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 
312 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  34.86 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  31.59 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  31.99 
 
 
305 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  31.36 
 
 
317 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>