More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4475 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
329 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  98.78 
 
 
329 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4320  thiamine-monophosphate kinase  96.85 
 
 
329 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.267415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  68.32 
 
 
325 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  43.87 
 
 
323 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  39.18 
 
 
318 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  38.87 
 
 
323 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  43.24 
 
 
315 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  38.56 
 
 
319 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  43.19 
 
 
338 aa  202  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  46.79 
 
 
322 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  46.79 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  43.6 
 
 
317 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  39.25 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  45.28 
 
 
315 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  38.24 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.96 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  42.59 
 
 
320 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 
323 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  41.74 
 
 
327 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  45.37 
 
 
317 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  44.55 
 
 
326 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  37.85 
 
 
323 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  42.63 
 
 
328 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  38.15 
 
 
323 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  43.65 
 
 
324 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  36.99 
 
 
318 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  37.85 
 
 
323 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 
323 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  45.45 
 
 
323 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  42.73 
 
 
335 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  37.62 
 
 
318 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.45 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.3 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.3 
 
 
318 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  37.65 
 
 
322 aa  189  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  43.75 
 
 
332 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  44.61 
 
 
338 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  42.41 
 
 
321 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  43.03 
 
 
331 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  40.67 
 
 
329 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  43.52 
 
 
322 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  40.31 
 
 
325 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  41.07 
 
 
323 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  44 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  43.52 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  38.64 
 
 
341 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  40.37 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  37.05 
 
 
335 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  38.94 
 
 
319 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  45.16 
 
 
319 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 
330 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  43.03 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  41.25 
 
 
324 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  38.58 
 
 
324 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  38.3 
 
 
325 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  42.42 
 
 
321 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  41.84 
 
 
365 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  41.23 
 
 
319 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  44.22 
 
 
323 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  45.45 
 
 
324 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  44.31 
 
 
321 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  38.15 
 
 
325 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  37.23 
 
 
326 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  38.34 
 
 
325 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  37.23 
 
 
326 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  35.89 
 
 
339 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  45.15 
 
 
324 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  40.54 
 
 
323 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  38.15 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  38.15 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  40.86 
 
 
325 aa  175  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  38.15 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  43.85 
 
 
323 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  38.15 
 
 
325 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  38.15 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  38.15 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  45.57 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  37.23 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  39 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  39.19 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  42.81 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  43.69 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  37.85 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  40.62 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  38.25 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  39.75 
 
 
329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  42.22 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.5 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  37.15 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 
327 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.53 
 
 
326 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  40.94 
 
 
324 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
318 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  44.04 
 
 
319 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  43.29 
 
 
334 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>