More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0085 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  41.46 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.09 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.05 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  37.1 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  34.02 
 
 		 346 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  31.53 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  30.5 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  29.38 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 		 369 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.48 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.62 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.84 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  33.9 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  31.62 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  32.12 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  33.33 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.38 
 
 		 318 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  32.86 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.36 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  32.73 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  31.79 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  31.09 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  31.17 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  30.66 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 		 323 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  30.09 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  31.65 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  28.84 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  33.64 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.33 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.03 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.03 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  32.11 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.81 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.03 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  28.7 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.53 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  31.6 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  31.58 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  33.03 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.76 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.21 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  31.95 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  32.32 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  30.06 
 
 		 346 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  29.41 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  32.24 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  30.85 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  33.69 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  32.32 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  34.46 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  31.89 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  30.41 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  33.21 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  28.79 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  32.52 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  32.32 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  32.32 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  32.32 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  32.32 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  32 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  30.29 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  29.33 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  32.01 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  32.01 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  32.01 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  30.98 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  32.04 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  32.01 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  31.89 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  29.17 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  28.1 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  29.68 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  27.52 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  30.86 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  29.66 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>