More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2786 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 314 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  42.9 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  38.21 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  42.86 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  41 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  38.84 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  42.72 
 
 		 326 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  41.53 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  41.53 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  41.53 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  41.53 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  41.53 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  41.53 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  41.53 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  39.57 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  42.72 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  42.72 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  42.72 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  41.2 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  41.2 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  42.62 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  43.09 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  39.74 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.82 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  30.63 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  38.7 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  39.16 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  39.87 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  39.88 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  38.39 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  42.3 
 
 		 329 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  33.97 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  43.28 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  40.59 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  38.63 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.23 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  37.23 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.23 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  36.84 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  37.23 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  38.58 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  41.64 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  42.86 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  37.46 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  40.45 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  37.46 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  37.15 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  38.56 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.53 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  33.33 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  37.58 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  36.42 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  36.11 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  39.33 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  36.62 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  36.11 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.56 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  37.58 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  34.44 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  36.11 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.49 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  36.72 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.88 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  32.39 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.84 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.53 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  37.68 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  32.37 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  34.09 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.51 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  42.81 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.74 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  39.2 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  32.72 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  38.02 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  33.76 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  40.19 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  35.23 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  44.57 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  32.48 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  40.19 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  40.51 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  38.41 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  32.95 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  39.43 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.7 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  38.91 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.38 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  40.88 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>