More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1021 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  100 
 
 
333 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  76.88 
 
 
323 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  77.19 
 
 
323 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  76.88 
 
 
323 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  76.88 
 
 
323 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  77.19 
 
 
323 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  75.55 
 
 
318 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  75.55 
 
 
318 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  75.55 
 
 
318 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  74.61 
 
 
318 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  69.91 
 
 
319 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  70.22 
 
 
318 aa  463  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  71.56 
 
 
323 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  68.65 
 
 
319 aa  461  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  68.65 
 
 
319 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  69.59 
 
 
318 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  58.2 
 
 
327 aa  355  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  57.89 
 
 
329 aa  352  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  57.28 
 
 
325 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  57.28 
 
 
325 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  57.28 
 
 
325 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  57.28 
 
 
325 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  57.28 
 
 
325 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  57.28 
 
 
325 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  57.28 
 
 
325 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  57.59 
 
 
329 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  57.28 
 
 
325 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  57.28 
 
 
325 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  57.59 
 
 
329 aa  348  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  53.75 
 
 
321 aa  348  8e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  57.41 
 
 
326 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  57.41 
 
 
326 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  57.41 
 
 
326 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  56.97 
 
 
323 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  57.1 
 
 
326 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  55.42 
 
 
324 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  51.1 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  55.11 
 
 
325 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  54.8 
 
 
326 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  53.87 
 
 
324 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  54.49 
 
 
326 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  53.89 
 
 
336 aa  328  7e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  54.18 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  54.18 
 
 
321 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  48.8 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  50.15 
 
 
334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  47.99 
 
 
325 aa  301  1e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  50.31 
 
 
315 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  48.29 
 
 
319 aa  276  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  50.15 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  49.54 
 
 
332 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  43.96 
 
 
320 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  47.76 
 
 
332 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  43.96 
 
 
320 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  47.5 
 
 
319 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  45.07 
 
 
341 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  46.5 
 
 
334 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  47.98 
 
 
321 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  45.02 
 
 
332 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  45.43 
 
 
330 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  48 
 
 
324 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  45.71 
 
 
320 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  47.87 
 
 
324 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  44.44 
 
 
317 aa  255  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  47.52 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  45.79 
 
 
325 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  44.51 
 
 
317 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  45.43 
 
 
323 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  46.89 
 
 
319 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  46.73 
 
 
335 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  43.81 
 
 
331 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  47.97 
 
 
335 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  45.51 
 
 
331 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  44.72 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  45.62 
 
 
324 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  47.26 
 
 
321 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  46.55 
 
 
338 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  42.86 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  46.6 
 
 
326 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  41.59 
 
 
316 aa  242  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  45.12 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  45.12 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  45.12 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  45.12 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  45.12 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  45.12 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  45.12 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  46.18 
 
 
332 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  45.26 
 
 
361 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  42.5 
 
 
321 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  43.62 
 
 
339 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  44.95 
 
 
361 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  45.57 
 
 
323 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  41.56 
 
 
322 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  44.21 
 
 
333 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  47.19 
 
 
332 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  41.56 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>