More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3288 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 316 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  54.49 
 
 		 317 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  58.36 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  54.1 
 
 		 344 aa  301  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  58.62 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  51.94 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  57.56 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  52.16 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  49.56 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  58.58 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  55.56 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  52.06 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  51.88 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  48.02 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  47.96 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  56.29 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  54.24 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  46.43 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  46.2 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  47.08 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  45.6 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  47.12 
 
 		 355 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  48.57 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  48.57 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  48.57 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  46.56 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  45.73 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  45.51 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  44.37 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  43.67 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  41.42 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  44.75 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  54.14 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  36.89 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  39.94 
 
 		 372 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  41.54 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.7 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.12 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.14 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  43.97 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  37.84 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  38.75 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  32.64 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  30.74 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.48 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.01 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.43 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  30.65 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  38.77 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  29.33 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  38.11 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  33.91 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  36.13 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  35.79 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  38.98 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  34.7 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  30.97 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  30.27 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  35.74 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  40.44 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  33.13 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  39.18 
 
 		 329 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  37.69 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  34.62 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  33.68 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  26.92 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  36.17 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  29.47 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  36.34 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  29.45 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.07 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  32.75 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  31.03 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  32.83 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  36.81 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  37.42 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  37.42 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  38.24 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  35.36 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  29.2 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  31.79 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  30.3 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  34.95 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  35.85 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  34.42 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  35.47 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  36.88 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  35.58 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  28.09 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  26.9 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.54 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  36.73 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  34.18 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>