More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1366 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 314 aa  587  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  57.19 
 
 		 332 aa  278  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  56.01 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  57.54 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  54.14 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  52.74 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  55.38 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  51.95 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  51.14 
 
 		 344 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  48.43 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  45.48 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  47.98 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  47.04 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  51.36 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  50 
 
 		 329 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  47.08 
 
 		 316 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  46.67 
 
 		 341 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  41.76 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  50.15 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  47.48 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  49.84 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  53.29 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  50.68 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  51.13 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  46.41 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  47.92 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  45.25 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  50.51 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  53.05 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  48.06 
 
 		 335 aa  175  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  49.32 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  49.32 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  49.32 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  45.14 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  39.48 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.49 
 
 		 344 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  36.23 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.76 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  37.25 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  37.87 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  34.03 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  34.93 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  34.53 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  38.91 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08710  thiamine-monophosphate kinase  38.89 
 
 		 382 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.12 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.47 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  29.7 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  30.21 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  24.09 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  26.93 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  33.77 
 
 		 272 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  31.17 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  37.08 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.37 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 		 346 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  41.79 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  32.57 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  30.6 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  36.33 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  32.48 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  36.75 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  39.11 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  32.9 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  34.14 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  32.75 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  32.9 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  33.8 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  32.9 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.05 
 
 		 344 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.12 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  39.07 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.12 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  37.35 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  40.15 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  37.91 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  28.11 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  35.59 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  32.09 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  26.8 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.554976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  38.21 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  31.95 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  34.65 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  36.09 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  32.79 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  35.31 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>