More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2512 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
341 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  72.16 
 
 
335 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  52.69 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  50.7 
 
 
341 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  48.21 
 
 
318 aa  252  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  47.25 
 
 
314 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  51.5 
 
 
346 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  44.02 
 
 
344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  43.24 
 
 
315 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  51.59 
 
 
327 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  44.69 
 
 
316 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  47.2 
 
 
375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  47.9 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  42.41 
 
 
355 aa  209  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  40.75 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  48.37 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  43.11 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  44.71 
 
 
317 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  42.39 
 
 
305 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  45.32 
 
 
327 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  43.81 
 
 
322 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  46.73 
 
 
294 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  42.68 
 
 
320 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08710  thiamine-monophosphate kinase  39.73 
 
 
382 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.827789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  41.72 
 
 
372 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  46.86 
 
 
328 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  43.4 
 
 
341 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  46.26 
 
 
333 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  45.29 
 
 
317 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  41.89 
 
 
329 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  36.15 
 
 
370 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  42.99 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  39.94 
 
 
361 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  44.88 
 
 
318 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  44.88 
 
 
318 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  44.88 
 
 
318 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  36.1 
 
 
343 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  34.74 
 
 
344 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  34 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  35.59 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  37.55 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 
356 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  33 
 
 
372 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  38.75 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  30.32 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  38.75 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  34.85 
 
 
323 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
318 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 
329 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
325 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  34.39 
 
 
325 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
325 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  38.49 
 
 
325 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  34.39 
 
 
325 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
325 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
325 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  30.64 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 
329 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  34.01 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  34.1 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.43 
 
 
323 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  34.21 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.51 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  31.86 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  34.88 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  33.67 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  34.86 
 
 
317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  32.07 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  30.47 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  35.02 
 
 
328 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.65 
 
 
344 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.59 
 
 
350 aa  113  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 
326 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 
326 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  27.99 
 
 
348 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 
326 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.26 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  29.83 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 
355 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  31.2 
 
 
326 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.33 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  32.84 
 
 
321 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  29.43 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  32.56 
 
 
329 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  33.22 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>