More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0643 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 329 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  66.77 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  60.12 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  58.64 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  60 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  55.95 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  53.41 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  58.78 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  53.44 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  61.54 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  59.18 
 
 		 317 aa  275  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  51.13 
 
 		 305 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  57.05 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  54.97 
 
 		 322 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  48.77 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  48.97 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  50.94 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  58.44 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  49.85 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  50.93 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  57.74 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  43.82 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  48.63 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  48.15 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  49.85 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  60.11 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  50.31 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  50.31 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  50.31 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  43.79 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  41.76 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  40.66 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  43.07 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  41.44 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  38.17 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  41.9 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.95 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.76 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  39.02 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  40.13 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.35 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  39.29 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  38.32 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.34 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.94 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  38.07 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  35.31 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  37.57 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  41.25 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  30.51 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.46 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  36.39 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  32.95 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  33.24 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  32.6 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  36.09 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.14 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  36.56 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  32.2 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  36.25 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  35.6 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  32.46 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.74 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  37.01 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  34.18 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  34.25 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.69 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  34.3 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  30.9 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  38.23 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  32.16 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.25 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  36.61 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  34.54 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  32.77 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  30.57 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.84 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  41.5 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  37.72 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  34.45 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  41.1 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.05 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  36.86 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  34.45 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  34.45 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.12 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>