More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2839 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 341 aa  645    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  56.15 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  48.81 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  57.14 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  48.9 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  53.16 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  50.9 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  51.55 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  48.92 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  46.03 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  51.58 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  50.31 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  48.12 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  45.7 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  49.15 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  50.16 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  49.06 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  48.92 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  50.77 
 
 		 346 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  49.85 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  55.59 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  46.78 
 
 		 341 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  52.52 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  52.52 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  52.52 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  50 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  53.02 
 
 		 294 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  39.64 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  45.16 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  46.06 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  43.22 
 
 		 355 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  46.85 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  50.16 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  41.58 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  41.29 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  38.63 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.89 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  42.64 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.63 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.06 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  34.64 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.92 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.38 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.36 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  32.27 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00281  putative thiamine-monophosphate kinase  35.23 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.85 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  31.75 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.36 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  26.72 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  32.04 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.13 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.45 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  29.51 
 
 		 355 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  35.89 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  28.77 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  35.41 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3570  thiamine-monophosphate kinase  36.4 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  34.73 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  32.32 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.46 
 
 		 539 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  32.29 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08710  thiamine-monophosphate kinase  34.88 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.827789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.65 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  41.7 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  36.23 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  32.58 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.48 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  27.06 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  31.29 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  30.04 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  35.58 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  32.25 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0027  thiamine-monophosphate kinase  34.12 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  29.33 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.94 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.81 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  35.92 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.94 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  32.64 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  28.99 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  25.8 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  26.48 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  34.22 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  33.69 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  34.22 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  34.09 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  33.09 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  30.03 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.06 
 
 		 309 aa  99.8  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  31.04 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  36.13 
 
 		 317 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  35.94 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  30.24 
 
 		 272 aa  99.4  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  34.44 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>