More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4040 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 328 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  60.4 
 
 		 300 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  58.15 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  55.19 
 
 		 318 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  55.56 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  54.73 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  56.44 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  54.79 
 
 		 305 aa  285  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  59.69 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  54.57 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  61.04 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  58.12 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  51.35 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  57.88 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  60 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  51.96 
 
 		 314 aa  248  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  51.35 
 
 		 341 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  58.06 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  51.11 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  47.56 
 
 		 355 aa  232  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  51.94 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  52.34 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  44.01 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  49.84 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  49.03 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  52.29 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  45.78 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  50.65 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  50.65 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  50.65 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  45.9 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  47.95 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  39.12 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  38.51 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  44.23 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  39.45 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.45 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  45 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  39.93 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  40.27 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  32.75 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  39.44 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.37 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.72 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  44.85 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  38.68 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  26.23 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  34.8 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  35.36 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.1 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  31.99 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  44.75 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  34.41 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  34.25 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  35.06 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  35.06 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  30.95 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  32.52 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  30.98 
 
 		 350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  34.04 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.15 
 
 		 355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  35.06 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  37.8 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  35.74 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.05 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.11 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.9 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.49 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  42.81 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  28.83 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  36.24 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.33 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  38.46 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.03 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.45 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.21 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  33.67 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  32.26 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 		 539 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.54 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  34.87 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  32.65 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.95 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  42.46 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  36.49 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  38.35 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  32.65 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 		 323 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  32.36 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  35.19 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>