More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8038 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
370 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  47.91 
 
 
344 aa  281  9e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  46.49 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  43.93 
 
 
341 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  39.83 
 
 
355 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  41.76 
 
 
314 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  43.37 
 
 
300 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  60.99 
 
 
317 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  43.54 
 
 
346 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  57.92 
 
 
375 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  43.55 
 
 
332 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  60.34 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  58.01 
 
 
318 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  40.82 
 
 
321 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  42.47 
 
 
317 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  54.95 
 
 
322 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  54.14 
 
 
316 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  61.59 
 
 
329 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  39.69 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  59.32 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  60.43 
 
 
294 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  37.73 
 
 
341 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  53.37 
 
 
327 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  37.43 
 
 
372 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  52.51 
 
 
322 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  50.32 
 
 
305 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  58.86 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  49.17 
 
 
320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  33.51 
 
 
339 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 
329 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  46.11 
 
 
333 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  48.24 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  41.9 
 
 
332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  40.66 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  28.91 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  30.73 
 
 
335 aa  126  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  46.95 
 
 
335 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  36.32 
 
 
314 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  43.41 
 
 
328 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  46.74 
 
 
323 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  43.09 
 
 
331 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  39.33 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  50.27 
 
 
318 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  50.27 
 
 
318 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  50.27 
 
 
318 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  37.7 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  40.11 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  41.24 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  31.15 
 
 
346 aa  119  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  45.39 
 
 
361 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 
329 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  41.01 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  37.36 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.56 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  42.37 
 
 
343 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  42.46 
 
 
337 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  38.76 
 
 
344 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  29.77 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  40.23 
 
 
334 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  42.08 
 
 
329 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  40.34 
 
 
346 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  40.54 
 
 
327 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  27.33 
 
 
344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  30.61 
 
 
355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  36.61 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  40.52 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  33.83 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  27.49 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  31.42 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  31.42 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  41.21 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 
348 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  31.42 
 
 
326 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  27.93 
 
 
355 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  36.86 
 
 
319 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  23.91 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  31.12 
 
 
326 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  27.97 
 
 
319 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  37.77 
 
 
339 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  39.46 
 
 
273 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  40.83 
 
 
323 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  28.06 
 
 
352 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  34.9 
 
 
272 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  40.45 
 
 
318 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 
318 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  31.38 
 
 
315 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  29.53 
 
 
363 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 
328 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  28.53 
 
 
340 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  38.86 
 
 
356 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  40.48 
 
 
320 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  44.12 
 
 
319 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  29.41 
 
 
354 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  32.15 
 
 
325 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  45.14 
 
 
337 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  44.38 
 
 
317 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  32.45 
 
 
325 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  29.85 
 
 
316 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>