More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4694 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
318 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  38.34 
 
 
329 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  38.64 
 
 
334 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  39.04 
 
 
338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  38.69 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  39.51 
 
 
327 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  38.58 
 
 
328 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  38.03 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  38.23 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  36.01 
 
 
339 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 
326 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  37.8 
 
 
318 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  37.61 
 
 
323 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
334 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.59 
 
 
319 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  40.62 
 
 
332 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  40.14 
 
 
323 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  40.14 
 
 
323 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  38.87 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  40.14 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  38.61 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  37.31 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  38.65 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  37.61 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.14 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  40.14 
 
 
318 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  38.28 
 
 
322 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  38.76 
 
 
332 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.14 
 
 
318 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  38.69 
 
 
333 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  39.33 
 
 
319 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  40.18 
 
 
335 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  36.39 
 
 
319 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  38.28 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  39.02 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 
329 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  39.02 
 
 
324 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  39.02 
 
 
324 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.95 
 
 
363 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  38.32 
 
 
320 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
354 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  36.09 
 
 
319 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  39.07 
 
 
323 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  33.72 
 
 
355 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 
323 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 
333 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  33.94 
 
 
320 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  33.94 
 
 
320 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  37.39 
 
 
323 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  37.39 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  37.39 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  37.39 
 
 
325 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  37.39 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  38.91 
 
 
319 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  37.08 
 
 
325 aa  175  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  37.39 
 
 
325 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  36.78 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  39.2 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.38 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  37.65 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  37.08 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  39.76 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  37.08 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  35.98 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  37.08 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  39.46 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
324 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  39.08 
 
 
361 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  39.08 
 
 
361 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  37.31 
 
 
329 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  37.01 
 
 
329 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 
341 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  37.98 
 
 
330 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  36.98 
 
 
319 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  40.98 
 
 
324 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  36.97 
 
 
326 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  36.97 
 
 
326 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 
326 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
319 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  33.05 
 
 
335 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 
326 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  37.98 
 
 
331 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  37.19 
 
 
325 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  35.82 
 
 
340 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  35.54 
 
 
336 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  37.01 
 
 
329 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 
324 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 
369 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  38.21 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  36.84 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  34.22 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>