More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0336 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 355 aa  720    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  71.19 
 
 		 355 aa  522  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  67.61 
 
 		 363 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  66.38 
 
 		 354 aa  498  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  63.17 
 
 		 355 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  61.34 
 
 		 369 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  60.62 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  44.35 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  44.89 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  44.07 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  44.48 
 
 		 346 aa  258  9e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  42.6 
 
 		 350 aa  256  6e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  41.14 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  41.21 
 
 		 348 aa  252  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  43.37 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  41 
 
 		 339 aa  246  6e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  40.57 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  38.83 
 
 		 334 aa  222  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  38.7 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.59 
 
 		 327 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  36.03 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.65 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.65 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  38.96 
 
 		 328 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.77 
 
 		 324 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  33.72 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  36.03 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  38.31 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  36.44 
 
 		 329 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.62 
 
 		 337 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  34.64 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  34.36 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.79 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  35.16 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.18 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.62 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  32.62 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  34.55 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.84 
 
 		 344 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  32.48 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.84 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  35.27 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  32.78 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  36.12 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.73 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  35.62 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  33.99 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.77 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.88 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  33.43 
 
 		 325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.07 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.57 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  32.58 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  35.77 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  31.09 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  29.94 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  33.24 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  34.2 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  33.05 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  33.05 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  32.95 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.47 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  33.62 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  36.18 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  30.9 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  31.82 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  31.5 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.41 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  33.7 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.19 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  32.73 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  32.73 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  32.3 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  32.16 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  30.09 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.12 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  35.34 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  29.8 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  30.84 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  33.54 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  33.52 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  33.24 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>