More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2521 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  100 
 
 		 346 aa  709    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  58.24 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  59.47 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  54.49 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  56.01 
 
 		 352 aa  401  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  53.69 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  53.25 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  53.8 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  53.2 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  50.74 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  46.4 
 
 		 358 aa  309  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  45.87 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  44.19 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  44.89 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  43.1 
 
 		 363 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  43.71 
 
 		 354 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  42.61 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  42.86 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  38.19 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  36.78 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  38.3 
 
 		 334 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  38.3 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.42 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  37.18 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  37.72 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.72 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  38.01 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  38.73 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  33.9 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  37.21 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.49 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.61 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.87 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  34.33 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  35.16 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 336 aa  167  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  34.02 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  33.92 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.78 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  33.92 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  36.81 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  34.21 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  33.91 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  33.81 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  34.78 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  31.99 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.02 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  34.02 
 
 		 317 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.02 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  34.87 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  33.83 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  33.66 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  35.01 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.76 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  29.38 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  33.14 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  34.32 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  34.41 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  37.93 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  30.72 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  32.26 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  37.59 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.59 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.02 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  30.84 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.59 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  32.59 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.52 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  35.52 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  35.52 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  32.64 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35.52 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  33.73 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.23 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  32.94 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  32 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  31.87 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  30.95 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  32.43 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  35.59 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  32.49 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>