More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1244 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 313 aa  630  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.38 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.57 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.37 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.73 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.28 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.79 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  36.59 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.84 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  39.38 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  34.98 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  35.98 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.38 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  31.66 
 
 		 369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  32.41 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  33.44 
 
 		 346 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.17 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  32.8 
 
 		 346 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  32.59 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  32.82 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.94 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  33.65 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.34 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 		 348 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  32.72 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  35.74 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  35.42 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  30.89 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  35.37 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  34.85 
 
 		 352 aa  138  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  34.82 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  33.05 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.11 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  37.76 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  32.8 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  37.76 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  37.76 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  37.76 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.72 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  37.72 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  37.72 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  37.72 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  37.41 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  38.08 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  34.49 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  31.1 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.55 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  32.38 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.74 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  32.64 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  33.83 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  37.63 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30.98 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  30.59 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  34.81 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  31.69 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  32.4 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  32.8 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  31.63 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  34.83 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.42 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.45 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  33.84 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  31.33 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.3 
 
 		 329 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  32.73 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  31.63 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  36.3 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.74 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  35.94 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  36.1 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  36.1 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  36.1 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  33.65 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  35.74 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  33.02 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  33.43 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  33.93 
 
 		 334 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  33.96 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  34.73 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  31.11 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  35.16 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  35.31 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  33.96 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>