More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2509 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 309 aa  611  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  41.33 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  37.68 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.15 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  35.98 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.97 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.85 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.55 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  35.83 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  35.15 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  37.79 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  31.46 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  36.96 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  35.92 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  36.2 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  39.6 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  37.15 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  32.63 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  35.91 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  36.39 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  37.15 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  37.04 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  37.21 
 
 		 321 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  36.39 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  37.79 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  29.86 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  35.76 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  35.2 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.84 
 
 		 325 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  39.27 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  32.82 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  34.23 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  37.14 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  38.95 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  35.42 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  37.55 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  33.87 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  37.8 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  36.3 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.64 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  34.07 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  37.94 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  37.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  36.73 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  36.73 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  35.58 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  36.96 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  34.47 
 
 		 319 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.69 
 
 		 329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  32.5 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  37.55 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  33.92 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.44 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  36.76 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.13 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  33.75 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  28.49 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.9 
 
 		 326 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  32.49 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  29.01 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  28.85 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  33.67 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  34.42 
 
 		 344 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  32.62 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  35.27 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  32.83 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  32.83 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  32.83 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  32.83 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  32.83 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  35.28 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  32.83 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  32.83 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  32.83 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  34.26 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>