More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0477 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
306 aa  620  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  41.46 
 
 
314 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.08 
 
 
334 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
323 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.54 
 
 
323 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  37.76 
 
 
358 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
323 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  32.92 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  33.77 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
323 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 
355 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  35.19 
 
 
323 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.45 
 
 
318 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  35.24 
 
 
363 aa  168  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  34.97 
 
 
354 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 
323 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34 
 
 
319 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.77 
 
 
333 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  31.79 
 
 
319 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  34.1 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  35.16 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  33.82 
 
 
369 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  35.55 
 
 
354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 
329 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 
319 aa  162  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  33.44 
 
 
323 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  33.74 
 
 
339 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  33.33 
 
 
346 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.45 
 
 
328 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  36.23 
 
 
338 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
344 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  34.73 
 
 
340 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  32.72 
 
 
326 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  33.72 
 
 
355 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  32.72 
 
 
326 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  32.1 
 
 
321 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  31.71 
 
 
327 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  36.3 
 
 
325 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  30.34 
 
 
324 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  32.42 
 
 
326 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  32.93 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  32.93 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  32.42 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 
336 aa  153  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  36.71 
 
 
346 aa  153  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 
325 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  34.15 
 
 
320 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  32.62 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.02 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  32.62 
 
 
325 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  32.62 
 
 
325 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.02 
 
 
329 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  34 
 
 
336 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  32.43 
 
 
346 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  32.39 
 
 
339 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  34.44 
 
 
327 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  30.77 
 
 
326 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  32.04 
 
 
336 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  32.72 
 
 
329 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  32.61 
 
 
323 aa  149  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  32.9 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  32.31 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  32.04 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  32.67 
 
 
318 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  30.77 
 
 
326 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.59 
 
 
350 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  31.99 
 
 
325 aa  146  5e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  33 
 
 
318 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  32.52 
 
 
352 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  32.33 
 
 
315 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.13 
 
 
337 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.05 
 
 
324 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.58 
 
 
325 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  32.32 
 
 
334 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  29.75 
 
 
324 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  30.56 
 
 
316 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  36 
 
 
314 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  30.86 
 
 
335 aa  142  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.6 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.27 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  31.77 
 
 
320 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  31.77 
 
 
320 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  29.66 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  32.96 
 
 
327 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
321 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  29.5 
 
 
329 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  31.12 
 
 
332 aa  138  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  32.92 
 
 
333 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>