More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1693 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
340 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  46.75 
 
 
334 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  41.25 
 
 
337 aa  215  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  43.92 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  39.36 
 
 
337 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  40.12 
 
 
339 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  39.47 
 
 
327 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  40.82 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  35.39 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  35.73 
 
 
355 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  41.11 
 
 
324 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.09 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  41.42 
 
 
329 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  36.68 
 
 
336 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 
363 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  36.9 
 
 
338 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  37.1 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  39.46 
 
 
323 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 
369 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  33.9 
 
 
346 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  37.11 
 
 
354 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  35.96 
 
 
354 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  35.53 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  39.47 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  34.33 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  39.47 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  35.73 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  39.18 
 
 
329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  38.41 
 
 
340 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  34.38 
 
 
358 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  35.93 
 
 
318 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.54 
 
 
321 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.95 
 
 
327 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  38.46 
 
 
329 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 
333 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  38.05 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  38.89 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  38.17 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.69 
 
 
326 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 
335 aa  162  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.9 
 
 
323 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  31.3 
 
 
346 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  36.8 
 
 
326 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  37.01 
 
 
375 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  34.32 
 
 
325 aa  160  4e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  36.8 
 
 
326 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  36.8 
 
 
326 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  36.8 
 
 
326 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.61 
 
 
325 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.83 
 
 
319 aa  159  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.61 
 
 
325 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.09 
 
 
323 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.61 
 
 
325 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.61 
 
 
325 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.61 
 
 
325 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.61 
 
 
325 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.61 
 
 
325 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  35.61 
 
 
325 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  35.61 
 
 
325 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  35.5 
 
 
334 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  36.12 
 
 
316 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  34.73 
 
 
306 aa  155  9e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  35.31 
 
 
318 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.79 
 
 
318 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  35.02 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30.84 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.13 
 
 
318 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  35.01 
 
 
323 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  33.63 
 
 
323 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  33.53 
 
 
319 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  41.84 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.13 
 
 
318 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  36.47 
 
 
318 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 
350 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  31.99 
 
 
346 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 
323 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 
323 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 
339 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 
336 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  34.13 
 
 
318 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.83 
 
 
318 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
320 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  34.59 
 
 
330 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
323 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.73 
 
 
319 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  38.55 
 
 
314 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  32.54 
 
 
318 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  27.49 
 
 
348 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  35.69 
 
 
338 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  34.63 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  38.85 
 
 
325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.33 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  34.93 
 
 
322 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  33.83 
 
 
318 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 
321 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  36.8 
 
 
324 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
335 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  35.03 
 
 
321 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>