More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0637 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 346 aa  704    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  55.88 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  57.1 
 
 		 350 aa  401  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  54.57 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  53.8 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  53.37 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  52.51 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  53.25 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  51.92 
 
 		 339 aa  352  8e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  49.55 
 
 		 339 aa  344  2e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  43.93 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  42.73 
 
 		 355 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  44.48 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  42.09 
 
 		 369 aa  252  7e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  42.3 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  41.46 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  41.33 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  42.44 
 
 		 354 aa  225  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  39.59 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  38.19 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.13 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.45 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  39.73 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  36.44 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.76 
 
 		 328 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  38.74 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  38.82 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.75 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  34.21 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  35.93 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.29 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 		 318 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  36.71 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  34.41 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  31.99 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  33.13 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  34 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  30.86 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.47 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.81 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  35.19 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  32.38 
 
 		 336 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.96 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.27 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.17 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  34.3 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  33.73 
 
 		 317 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  34.22 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  33.55 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  33.01 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  30.46 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  29.55 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  36.93 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  31.59 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  36.93 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  30.96 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.33 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.86 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  32.09 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  32.59 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.19 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  32.75 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  32.75 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  31.35 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  33.22 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  32.06 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  34.22 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  31.72 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  31.97 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  33.11 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  33.75 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  34.71 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.14 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  34.84 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  30.98 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  34.15 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  33.24 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  33.91 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  33.1 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  31.56 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  32.87 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  34.15 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  32.63 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  32.64 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  34.43 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  33.24 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  34.69 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  29.94 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  32.14 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>