More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5985 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 321 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  67.7 
 
 		 322 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  63.46 
 
 		 305 aa  362  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  58.33 
 
 		 317 aa  328  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  56.27 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  61.29 
 
 		 317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  55.56 
 
 		 316 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  61.15 
 
 		 300 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  53.33 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  50.87 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  61.24 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  52.38 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  52.38 
 
 		 320 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  48.79 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  56.92 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  51.05 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  61.18 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  50 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  49.84 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  47.92 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  51.6 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  51.6 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  51.6 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  55.93 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  47.02 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  42.82 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  47.84 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  44.27 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  40.82 
 
 		 370 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  48.9 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  40.18 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  38.64 
 
 		 361 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  44.07 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.7 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  42.99 
 
 		 341 aa  175  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  42.49 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  38.77 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  33.84 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  36.39 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  43.25 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  42.09 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  42.09 
 
 		 372 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  41.39 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  35.13 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  34.08 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  40.51 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  34.3 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  34.02 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.88 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  34.64 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  36.27 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  38.54 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  36.69 
 
 		 354 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  32.65 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  34.22 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  36.45 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  37.41 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  33.64 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  39.21 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  32.61 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  38.49 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  38.19 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.65 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  38.13 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  41.79 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  38.82 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  36.79 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  36.88 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 329 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  33.43 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  38.51 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  37.35 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.58 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  31.51 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  36.22 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  34.28 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  33.13 
 
 		 337 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  28.73 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  34.16 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  38.85 
 
 		 372 aa  132  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  43.77 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.59 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  29.87 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  39.33 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  33.86 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>