More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  100 
 
 		 322 aa  624  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  67.7 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  60.7 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  63.14 
 
 		 300 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  57.56 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  56.31 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  55.45 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  54.92 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  52.62 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  58.2 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  52.11 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  54.29 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  54.11 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  50.3 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  52.37 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  54.26 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  58.44 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  54.83 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  58.42 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  58.78 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  48.46 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  52.56 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  52.56 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  52.56 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  50.68 
 
 		 314 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  47.02 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  50.31 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  48.25 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  50.94 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  48.04 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  39.2 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  40.3 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  39.79 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  42.39 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  54.95 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  42.03 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  41.48 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  43.22 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.59 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  34.17 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  34.28 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  41.01 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  45.09 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  39 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.83 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  40.43 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  32.28 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  31.44 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  37.99 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  33.99 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  37.59 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  46.55 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  45.05 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  37.09 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  37.09 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  44.19 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  32.18 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  43.82 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  38.85 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.89 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  33.84 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  32.92 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  37.5 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  37.59 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  36.65 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  33.24 
 
 		 358 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.57 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  32.76 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  31.25 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  33.68 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  31.69 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  31.69 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  33.24 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  36.3 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.74 
 
 		 539 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  34.14 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  32.42 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  38.08 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  27.24 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  40.5 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.95 
 
 		 318 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  32.91 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  34.45 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.81 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.16 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  37.55 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  42.86 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.98 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  36.73 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.57 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  35.06 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.76 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  35.69 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>