More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5192 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
339 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  64.69 
 
 
340 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  53.69 
 
 
346 aa  388  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  52.82 
 
 
350 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  51.63 
 
 
348 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  51.93 
 
 
352 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  51.04 
 
 
346 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  52.68 
 
 
339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  51.92 
 
 
346 aa  352  7e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  48.66 
 
 
344 aa  349  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  42.69 
 
 
358 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  44.95 
 
 
363 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  43.98 
 
 
355 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  43.47 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  43.67 
 
 
369 aa  253  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  42.4 
 
 
355 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  43.37 
 
 
355 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  42.73 
 
 
354 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  40.2 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  40.23 
 
 
328 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.83 
 
 
323 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  36.01 
 
 
318 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.93 
 
 
324 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.34 
 
 
327 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.84 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  36.34 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  37.19 
 
 
333 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  37.28 
 
 
329 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  36.45 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  34.29 
 
 
334 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  36.95 
 
 
337 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  35.26 
 
 
336 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  35.14 
 
 
332 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  34.57 
 
 
346 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  35.69 
 
 
318 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  35.55 
 
 
318 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  35.35 
 
 
323 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
338 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  33.92 
 
 
329 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  37.02 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  32.39 
 
 
306 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 
340 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.65 
 
 
323 aa  149  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 
336 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  32.59 
 
 
313 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 
315 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  33.04 
 
 
336 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.95 
 
 
323 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  33.12 
 
 
329 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  36.58 
 
 
333 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  35.74 
 
 
318 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  36.94 
 
 
324 aa  142  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.18 
 
 
318 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  34.93 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
323 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.42 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
323 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
323 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  32.61 
 
 
321 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
323 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  30.7 
 
 
344 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 
335 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  30.7 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  30.63 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  32.21 
 
 
332 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  31.66 
 
 
323 aa  135  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  36.11 
 
 
324 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  36.22 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  34.21 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  32.76 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  31.13 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  35.4 
 
 
319 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  32 
 
 
335 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
318 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  32.53 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
320 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 
326 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 
344 aa  133  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  33.22 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  33.72 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  34.17 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  32.28 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  34.71 
 
 
343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  35.46 
 
 
326 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  30.58 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  36.52 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  30.65 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>