More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04400 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 352 aa  721    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  70.11 
 
 		 348 aa  528  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  70.23 
 
 		 350 aa  518  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  56.77 
 
 		 346 aa  424  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  56.01 
 
 		 346 aa  401  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  56.05 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  55.88 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  52.07 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  53.27 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  51.93 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  42.98 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 		 363 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  41.67 
 
 		 369 aa  255  7e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  43.29 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  40.48 
 
 		 354 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  41.1 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  40.46 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  34.71 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  41.52 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.79 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  39.51 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  38.7 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  32.35 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  34.39 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.89 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  35.12 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.95 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.03 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.92 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.09 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.47 
 
 		 318 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  34.02 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  31.3 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.05 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.58 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  32.52 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  33.97 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.4 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  30.49 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  32.64 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  30.74 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  30.75 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  29.38 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  36.52 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  35.52 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.02 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  29 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  29.22 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  33.69 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  34.85 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  34.84 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  31.48 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  31.29 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.16 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.16 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.86 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.76 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.84 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  31.87 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  31.87 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  31.87 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  31.87 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  32.66 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  31.49 
 
 		 336 aa  136  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  32.11 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  31.98 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  31.76 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  31.58 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  32.29 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  34.39 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  31.58 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  31.58 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  31.58 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  32.16 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  31.36 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  32.16 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  29.2 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  34.49 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  32.16 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  27.38 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  32.82 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  31.69 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  31.67 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.79 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  30.54 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  29 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.1 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  30.9 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  34.43 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>