More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1874 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
320 aa  635    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  31.27 
 
 
328 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  29.85 
 
 
329 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  30.18 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  32.97 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  29.82 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.11 
 
 
334 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  29.93 
 
 
318 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  27.05 
 
 
344 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  26.77 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  31.42 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  27.03 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  33 
 
 
344 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  29.25 
 
 
332 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.8 
 
 
355 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  32.3 
 
 
318 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 
363 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  29.55 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  30.51 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  30.18 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 
318 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  32.03 
 
 
313 aa  134  3e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.33 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.54 
 
 
319 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  31.9 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  28.52 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  30.31 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  31.47 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  29.05 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  27.45 
 
 
327 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  30.06 
 
 
318 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  28.06 
 
 
339 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  32.71 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  30.42 
 
 
320 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  24.19 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  32.43 
 
 
319 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  31.06 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  27.76 
 
 
300 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  31.83 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  24.25 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.4 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  31.74 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  24.09 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  31.06 
 
 
318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  31.66 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  29.71 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  26.92 
 
 
316 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  26.98 
 
 
324 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  25.66 
 
 
326 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  27.03 
 
 
323 aa  125  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  31.96 
 
 
319 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 
323 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  30.2 
 
 
354 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  26.69 
 
 
324 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  30.69 
 
 
350 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 
323 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  29.18 
 
 
337 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  30.9 
 
 
332 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 
323 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  35.74 
 
 
306 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 
323 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 
358 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  24.44 
 
 
355 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  32.43 
 
 
329 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  33.54 
 
 
314 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.73 
 
 
324 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  30.85 
 
 
352 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  31.99 
 
 
339 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  33.96 
 
 
354 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  28.87 
 
 
329 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  27.54 
 
 
375 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  25.59 
 
 
332 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  30.45 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  28.87 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  25.91 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  30.45 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  29.01 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  24.24 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  28.52 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.55 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  31.16 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  28.87 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  29.35 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  28.92 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 
325 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  29.49 
 
 
329 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  31.36 
 
 
322 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  30.1 
 
 
325 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  30.58 
 
 
323 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  29.72 
 
 
340 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  29.17 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  29.86 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>